福建物构所由我国著名科学家、教育家卢嘉锡院士于1960年创建，是中科院优秀研究所。2010年6月18日，中国科学院、福建省人民政府、福州市人民政府举行了共建中国科学院海西研究院的签约、授牌和奠基仪式，海西研究院以福建物构所为基础和法人依托，下设物质结构研究所、材料工程研究所、先进制造技术集成研究所、厦门稀土材料研究所、泉州装备制造研究所等5个研究所及海峡两岸科技合作交流中心和中科院海西育成中心。

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